26 мая 2022 года состоялось совместное расширенное заседание Ученого совета ИБФРМ РАН и Саратовского отделения ММО «Микробиологическое общество»

26 мая 2022 года состоялось совместное расширенное заседание Ученого совета ИБФРМ РАН и Саратовского отделения ММО «Микробиологическое общество». На нем был заслушан доклад д.х.н., профессора Сергея Юрьевича Щёголева «Об актуальной полногеномной систематике прокариотов на примере изолятов из суспензионной культуры Arabidopsis thaliana и ризосферы картофеля, как представителей семейства Micrococcaceae». В докладе обсуждались общие принципы и проблемы современной систематики прокариотов, представлены актуальные полногеномные технологии их филогенетических исследований. Приведенные в докладе результаты комплексных биоинформатических исследований указанных выше изолятов (выделенных сотрудниками ИБФРМ РАН во взаимодействии с учеными из Саратовского аграрного университета) с применением тестов 16S рРНК, ITS1, ANI, AAI и технологии GTDB (База данных геномной таксономии, Parks et al., 2020), продемонстрировали их принадлежность родам Rothia и Kocuria и выявили необходимость верификации видовой/родовой принадлежности многих штаммов, родственных данным изолятам, в пределах семейства Micrococcaceae. В качестве примера развития метагеномных филогенетических исследований отмечена работа Olm et al. (2020), в которой установлена целесообразность использования генетических последовательностей ряда однокопийных белков рибосомы, как альтернативы 16S рРНК и полногеномным тестам в довольно распространенных случаях, когда возможности восстановления полных геномов метагеномных объектов оказываются ограниченными.