Заведующий лабораторией Андрей Вячеславович Шелудько, д.б.н.Лаборатория генетики микроорганизмов, созданная в ИБФРМ АН СССР (ныне ИБФРМ РАН) в 1985 г., ведет свое начало от лаборатории культивирования микроорганизмов, организованной в 1981 г. Генетические работы были инициированы молодым талантливым ученым Вадимом Юрьевичем Матвеевым (08.10.1960–28.12.1988). В течение первых 24-х лет лабораторией заведовал д.б.н., проф. Валерий Иванович Панасенко (14.03.1937–27.07.2005).
С 2005 по 2020 гг. лабораторией генетики микроорганизмов руководила д.б.н., проф. Елена Ильинична Кацы.
Сейчас в лаборатории работают: д.б.н. Андрей Вячеславович Шелудько, к.б.н. Лилия Петровна Петрова, к.б.н. Юлия Анатольевна Филипьечева, к.б.н. Игорь Викторович Борисов, Елизавета Михайловна Телешева, Дмитрий Игоревич Мокеев, Стелла Сергеевна Евстигнеева и Лариса Ивановна Мотузко.
Основное направление работы коллектива лаборатории — изучение у бактерий, стимулирующих рост и развитие растений, генетической регуляции процессов, влияющих на формирование и функционирование ризоценозов: подвижности; образования двигательных органелл и гликополимеров клеточной поверхности; функций плазмид и динамики геномов.
сотрудники лаборатории (слева направо): к.б.н. И.В. Борисов, д.б.н. А.В. Шелудько, студент Д.Н. Синякин, Е.М. Телешева, Л.И. Мотузко, Д.И. Мокеев, к.б.н. Ю.А. Филипьечева, к.б.н. Л.П. Петрова, С.С. ЕвстигнееваДля выяснения механизмов адаптации бактерий к обитанию в гетерогенных экологических нишах, в том числе, в ассоциациях с растениями, необходимо исследовать молекулярные причины и физиологические последствия динамической организации бактериальных геномов. В лаборатории генетики микроорганизмов получены новые данные о первичной структуре, функциях и молекулярных основах пластичности крупных плазмид ассоциативных бактерий
Azospirillum brasilense, в частности, обусловленной активностью впервые описанных инсерционных элементов.
На примере
A. brasilense установлено влияние динамики генома на строение бактериальных липополисахаридов, устойчивость бактерий к ионам тяжелых металлов и нитритам, социальную активность бактерий и ранние этапы колонизации корней растений.
Выявлена способность азоспирилл к такому виду социальной подвижности как распространение в полужидкой среде с образованием микроколоний. Определены внешние факторы (присутствие определенных растительных лектинов, экссудатов растений и др.), сказывающиеся на социальном поведении бактерий.
Показано, что спонтанные и индуцированные изменения в структуре плазмид могут сопровождаться фенотипическими вариациями в социальной подвижности азоспирилл (роение → ускоренное роение; роение → распространение с образованием микроколоний; распространение с образованием микроколоний → ускоренное роение) и приводить к изменениям в первых этапах колонизации корней растений.
Исследованы особенности ранних стадий взаимодействия бактерий
A. brasilense с изменениями в структуре клеточной поверхности, жгутиковании и социальной подвижности с растениями пшеницы, в том числе, в условиях загрязнения среды ионами тяжелых металлов.
Идентифицированы новые гены азоспирилл, оказывающие существенное влияние на образование жгутиков двух типов, клеточную дифференциацию и подвижность бактерий в средах разной плотности, формирование бактериальных биопленок на абиотических и биотических поверхностях.
Разработана обширная коллекция олигонуклеотидных праймеров к нескольким репликонам бактерий
A. brasilense Sp245 и Sp7, использование которых в полимеразных цепных реакциях позволяет осуществлять быстрый мониторинг геномных перестроек у разных штаммов азоспирилл, амплифицировать и анализировать новые гены азоспирилл.
Полученные результаты могут найти дальнейшее практическое применение при конструировании или селекции ассоциативных бактерий, перспективных для сельского хозяйства, садоводства, лесоводства и фиторемедиации; при создании оригинальных биосенсоров, предназначенных для мониторинга состояния окружающей среды.
Монографии:1. Кацы Е.И. Молекулярно-генетические процессы, влияющие на ассоциативное взаимодействие почвенных бактерий с растениями / Под ред. В.В. Игнатова. Саратов: Изд-во Сарат. ун-та, 2003. 169 с.
2. Кацы Е.И. Молекулярная генетика ассоциативного взаимодействия бактерий и растений: состояние и перспективы исследований / Под ред. В.В. Игнатова. М.: Наука, 2007. 86 с.
3. Katsy E.I. (ed.) Plasticity in Plant-Growth-Promoting and Phytopathogenic Bacteria. New York: Springer, 2014. 208 p.
Главы в монографиях:1. Кацы Е.И. Молекулярно-генетический анализ ассоциативного взаимодействия бактерий и растений // Молекулярные основы взаимоотношений ассоциативных микроорганизмов с растениями / Под ред. В.В. Игнатова. М.: Наука, 2005. С. 17–45
2. Katsy E.I. Plasmid plasticity in the plant-associated bacteria of the genus
Azospirillum // Bacteria in Agrobiology: Plant Growth Responses / Ed. D.K. Maheshwari. Berlin: Springer, 2011. P. 139–157
3. Katsy E.I. Denitrification in plant-beneficial bacteria: genetic aspects and role in plant-bacterial interactions // Denitrification: Processes, Regulation and Ecological Significance / Eds. N. Savaglio, R. Puopolo. New York: Nova Science Publishers, 2012. P. 279–290
4. Katsy E.I. Plasmids as indispensable components of
Azospirillum genomes // Plasmids: Genetics, Applications and Health / Eds. F.E.R. Gonzales, M.I. Lopez. New York: Nova Science Publishers, 2012. P. 57–77
5. Scortichini M., Katsy E.I. Common themes and specific features in the genomes of phytopathogenic and plant-beneficial bacteria // Plasticity in Plant-Growth-Promoting and Phytopathogenic Bacteria / Ed. E.I. Katsy. New York: Springer, 2014. P. 1–26
6. Katsy E.I. Plasmid rearrangements and changes in cell-surface architecture and social behavior of
Azospirillum brasilense // Plasticity in Plant-Growth-Promoting and Phytopathogenic Bacteria / Ed. E.I. Katsy. New York: Springer, 2014. P. 81–97
Докторские диссертации:1. Кацы Е.И. Молекулярно-генетические аспекты образования у
Azospirillum brasilense О-специфических полисахаридов, двигательных органелл и экстраклеточных метаболитов, важных для взаимодействия этих бактерий с растениями: Дисс. д-ра биол. наук. М.: Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, 2002.
2. Шелудько А.В. Генетико-физиологические аспекты социального поведения ассоциативных бактерий
Azospirillum brasilense: Дисс. д-ра биол. наук. Саратов: ИБФРМ РАН, 2010
Кандидатские диссертации: 1. Кацы Е.И. Изучение плазмид азотфиксирующих ассоциированных со злаками бактерий
Azospirillum brasilense: Дисс. канд. биол. наук. Саратов: ВНИПЧИ «Микроб», 1991
2. Петрова Л.П. Генетические аспекты продукции компонентов клеточной поверхности у ассоциативных азотфиксирующих бактерий
Azospirillum brasilense: Дисс. канд. биол. наук. Саратов: РосНИПЧИ «Микроб», 1998
3. Шелудько А.В. Получение и характеристика мутантов модельного штамма ассоциативных бактерий
Azospirillum brasilense Sp245 по продукции и функционированию полярного и латеральных жгутиков: Дисс. канд. биол. наук. Саратов: РосНИПЧИ «Микроб», 2000
4. Борисов И.В. Генетический анализ вариаций в подвижности и поверхностных структурах ассоциативных бактерий
Azospirillum brasilense: Дисс. канд. биол. наук. Саратов: ИБФРМ РАН, 2004
5. Кулибякина О.В. Изучение роли плазмид
Azospirillum brasilense в образовании липополисахаридов, содержащих пента-D-рамнановый О-полисахарид: Дисс. канд. биол. наук. Саратов: ИБФРМ РАН, 2009
6. Варшаломидзе О.Э. Плазмидные перестройки и изменения в подвижности, метаболизме азота и устойчивости к солям тяжелых металлов у бактерий
Azospirillum brasilense. Дисс. канд. биол. наук. Саратов: ИБФРМ РАН, 2012
7. Ковтунов Е.А. Изменения в структуре ДНК у мутантов ассоциативных альфапротеобактерий
Azospirillum brasilense по жгутикованию и социальному поведению: Дисс. канд. биол. наук. Саратов: ИБФРМ РАН, 2014
В лаборатории проходят
обучение аспиранты ИБФРМ РАН, выполняют курсовые и дипломные работы студенты Саратовского государственного университета им. Н.Г. Чернышевского.
Исследования лаборатории были поддержаны
грантами Президента РФ (НШ-1529.2003.4, МК-235.2003.04, МК-948.2005.4, НШ-6177.2006.4, НШ-3171.2008.4), Международного научного фонда и Правительства РФ (RNQ000, RNQ300), CRDF и Министерства образования и науки РФ (REC-006), Роснауки (2005-РИ-112/001), Российского фонда фундаментальных исследований (93-04-6884-а, 99-04-48034-а, 06-04-48204-а, 12-04-00262-а, 13-04-01276-а, 20-04-00006-а и др.), Фонда содействия отечественной науке и ряда других научных фондов.
Научная и научно-организационная работа сотрудников лаборатории неоднократно отмечалась разного уровня Почетными грамотами , премиями и благодарностями.
Избранные статьи в журналах:1. Shelud’ko A.V., Mokeev D.I., Evstigneeva S.S., Filip’echeva Yu.A., Burov A.M., Petrova L.P., Ponomareva E.G., Katsy E.I. Cell ultrastructure in biofilms of Azospirillum brasilense // Microbiology. 2020. Vol. 89, № 1. P. 50–63. doi: 10.1134/S0026261720010142
2. Shelud’ko A.V., Filip’echeva Y.A., Telesheva E.M., Yevstigneeva S.S., Petrova L.P., Katsy E.I. Polar flagellum of the alphaproteobacterium Azospirillum brasilense Sp245 plays a role in biofilm biomass accumulation and in biofilm maintenance under stationary and dynamic conditions // World J. Microbiol. Biotechnol. 2019. Vol. 35, № 2. P. 19. doi: 10.1007/s11274-019-2594-0
3. Shelud’ko A.V., Filip’echeva Y.A., Telesheva E.M., Yevstigneyeva S.S., Petrova L.P., Katsy E.I. Restoration of polar-flagellum motility and biofilm-forming capacity in the mmsB1 mutant of the alphaproteobacterium Azospirillum brasilense Sp245 points to a new role for a homologue of 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase // Can. J. Microbiol. 2019. Vol. 65, № 2. P. 144–154. doi: 10.1139/cjm-2018-0481
4. Filip’echeva Y.A., Shelud’ko A.V., Prilipov A.G., Burygin G.L., Telesheva E.M., Yevstigneyeva S.S., Chernyshova M.P., Petrova L.P., Katsy E.I. Plasmid AZOBR_p1-borne fabG gene for putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase is essential for proper assembly and work of the dual flagellar system in the alphaproteobacterium Azospirillum brasilense Sp245 // Can. J. Microbiol. 2018. Vol. 64, № 2. P. 107–118. doi: 10.1139/cjm-2017-0561
5. Filip’echeva Yu., Shelud’ko A., Prilipov A., Telesheva E., Mokeev D., Burov A., Petrova L., Katsy E. Chromosomal flhB1 gene of the alphaproteobacterium Azospirillum brasilense Sp245 is essential for correct assembly of both constitutive polar flagellum and inducible lateral flagella // Folia Microbiol. 2018. Vol. 63, № 2. P. 147–153. doi: 10.1007/s12223-017-0543-6
6. Ponomareva E.G., Kupryashina M.A., Shelud’ko A.V., Petrova L.P., Vetchinkina E.P., Katsy E.I., Nikitina V.E. Phenol oxidase activity of Azospirillum brasilense Sp245 mutants with modified motility and Azospirillum brasilense Sp7 phase variants with different plasmid composition // Microbiology. 2018. Vol. 87, № 2. P. 222–228. doi: 10.1134/S0026261718020091
7. Shelud’ko A.V., Filip’echeva Yu. A., Telesheva E.M., Burov A.M., Evstigneeva S.S., Burygin G.L., Petrova L.P. Characterization of carbohydrate-containing components of Azospirillum brasilense Sp245 biofilms // Microbiology. 2018. Vol. 87, № 5. P. 610–620. doi: 10.1134/S0026261718050156
8. Petrova L.P., Prilipov A.G., Katsy E.I. Detection of putative polysaccharide biosynthesis genes in Azospirillum brasilense strains from serogroups I and II // Russ. J. Genet. 2017. Vol. 53, № 1. P. 39–48. doi:10.1134/S1022795416110107
9. Tugarova A.V., Scheludko A.V., Dyatlova Y.A., Filip'echeva Y.A., Kamnev A.A. FTIR spectroscopic study of biofilms formed by the rhizobacterium Azospirillum brasilense Sp245 and its mutant Azospirillum brasilense Sp245.1610 // J. Mol. Struct. 2017. Vol. 1140. P. 142–147. doi: 10.1016/j.molstruc.2016.12.063
10. Shumilova E.M., Shelud’ko A.V., Filip’echeva Y.A., Evstigneeva S.S., Ponomareva E.G., Petrova L.P., Katsy E.I. Changes in cell surface properties and biofilm formation efficiency in Azospirillum brasilense Sp245 mutants in the putative genes of lipid metabolism mmsB1 and fabG1 // Microbiology. 2016. Vol. 85, № 2. P. 172–179. doi:10.1134/S002626171602017X
11. Katsy E.I., Petrova L.P. Genome rearrangements in Azospirillum brasilense Sp7 with the involvement of the plasmid pRhico and the prophage ΦAb-Cd // Russ. J. Genet. 2015. Vol. 51, № 12. P. 1165–1171. doi: 10.1134/S1022795415110095
12. Katsy E.I., Prilipov A.G. Insertional mutation in the AZOBR_p60120 gene is accompanied by defects in the synthesis of lipopolysaccharide and calcofluor-binding polysaccharides in the bacterium Azospirillum brasilense Sp245 // Russ. J. Genet. 2015. Vol. 51, № 3. P. 245–250. doi: 10.1134/S1022795415030059
13. Shelud’ko A.V., Filip’echeva Y.A., Shumilova E.M., Khlebtsov B.N., Burov A.M., Petrova L.P., Katsy E.I. Changes in biofilm formation in the nonflagellated flhB1 mutant of Azospirillum brasilense Sp245 // Microbiology. 2015. Vol. 84, № 2. P. 144–151. doi: 10.1134/S002626171501012
14. Shelud’ko A.V., Burygin G.L., Filip’echeva Y.A., Belyakov A.E., Shirokov A.A., Burov A.M., Katsy E.I., Shchegolev S.Y., Matora L.Y. Serological relationships of azospirilla revealed by their motility patterns in the presence of antibodies to lipopolysaccharides // Microbiology. 2014. Vol. 83, № 1–2. P. 102–109. doi: 10.1134/S0026261714020179
15. Kovtunov E.A., Petrova L.P., Shelud’ko A.V., Katsy E.I. Transposon insertion into a chromosomal copy of flhB gene is concurrent with defects in the formation of polar and lateral flagella in bacterium Azospirillum brasilense Sp245 // Russ. J. Genet. 2013. Vol. 49, № 8. P. 881–884. doi: 10.1134/S1022795413080061
16. Kovtunov E.A., Shelud’ko A.V., Chernyshova M.P., Petrova L.P., Katsy E.I. Mutants of bacterium Azospirillum brasilense Sp245 with Omegon insertion in mmsB or fabG genes of lipid metabolism are defective in motility and flagellation // Russ. J. Genet. 2013. Vol. 49, № 11. P. 1107–1111. doi: 10.1134/S1022795413110112
17. Shelud’ko A.V., Tugarova A.V., Il’chukova A.V., Varshalomidze O.E., Antonyuk L.P., El’-Registan G.I., Katsy E.I. Negative effect of alkylresorcinols on motility of rhizobacteria Azospirillum brasilense // Microbiology. 2013. Vol. 82, № 4. P. 434–438. doi: 10.1134/S0026261713040103
18. Shelud'ko A.V., Varshalomidze O.E., Petrova L.P., Katsy E.I. Effect of genomic rearrangement on heavy metal tolerance in the plant-growth-promoting rhizobacterium Azospirillum brasilense Sp245 // Folia Microbiol. 2012. Vol. 57, № 1. P. 5–10. doi: 10.1007/s12223-011-0074-5
19. Varshalomidze O.E., Petrova L.P., Shelud’ko A.V., Katsy E.I. Spontaneous super-swarming derivatives of Azospirillum brasilense Sp245 have different DNA profiles and behavior in the presence of various nitrogen sources // Indian J. Microbiol. 2012. Vol. 52, № 4. P. 689–694. doi: 10.1007/s12088-012-0315-6
20. Kovtunov E.A., Shelud’ko A.V., Katsy E.I. Alterations in the primary structure of an 85-MDa plasmid affecting flagellation and motility in the bacterium Azospirillum brasilense Sp245 // Russ. J. Genet. 2012. Vol. 48, № 1. P. 125–128. doi: 10.1134/S1022795412010115
21. Fedonenko Y.P., Katsy E.I., Petrova L.P., Boyko A.S., Zdorovenko E.L., Kachala V.V., Shashkov A.S., Knirel Y.A. The structure of the O-specific polysaccharide from a mutant of nitrogen-fixing rhizobacterium Azospirillum brasilense Sp245 with an altered plasmid content // Russ. J. Bioorg. Chem. 2010. Vol. 36, № 2. P. 219–223. doi:10.1134/S1068162010020111
22. Katsy E.I., Petrova L.P., Kulibyakina O.V., Prilipov A.G. Analysis of Azospirillum brasilense plasmid loci coding for (lipo)polysaccharides synthesis enzymes // Microbiology. 2010. Vol. 79, № 2. P. 216–222. Doi: 10.1134/S002626171002013X
23. Petrova L.P., Shelud’ko A.V., Katsy E.I. Plasmid rearrangements and alterations in Azospirillum brasilense biofilm formation // Microbiology. 2010. Vol. 79, № 1. P. 121–124. Doi: 10.1134/S0026261710010169
24. Petrova L.P., Varshalomidze O.E., Shelud’ko A.V., Katsy E.I. Localization of denitrification genes in plasmid DNA of bacteria Azospirillum brasilense // Russ. J. Genet. 2010. Vol. 46, № 7. P. 801–807. Doi: 10.1134/S1022795410070045
25. Shelud’ko A.V., Shirokov A.A., Sokolova M.K., Sokolov O.I., Petrova L.P., Matora L.Yu., Katsy E.I. Wheat root colonization by Azospirillum brasilense strains with different motility // Microbiology. 2010. Vol. 79, № 5. P. 688–695. doi: 10.1134/S0026261710050140
26. Borisov I.V., Schelud’ko A.V., Petrova L.P., Katsy E.I. Changes in Azospirillum brasilense motility and the effect of wheat seedling exudates // Microbiol. Res. 2009. Vol. 164, № 5. P. 578–587. doi: 10.1016/j.micres.2007.07.003
27. Katsy E.I., Prilipov A.G. Mobile elements of an Azospirillum brasilense Sp245 85-MDa plasmid involved in replicon fusions // Plasmid. 2009. Vol. 62, № 1. P. 22–29. Doi: 10.1016/J.Plasmid.2009.02.003
28. Schelud’ko A.V., Makrushin K.V., Tugarova A.V., Krestinenko V.A., Panasenko V.I., Antonyuk L.P., Katsy E.I. Changes in motility of the rhizobacterium Azospirillum brasilense in the presence of plant lectins // Microbiol. Res. 2009. Vol. 164, № 2. P. 149–156. doi: 10.1016/j.micres.2006.11.008
29. Shelud’ko A.V., Ponomareva E.G., Varshalomidze O.E., Vetchinkina E.P., Katsy E.I., Nikitina V.E. Hemagglutinating activity and motility of the bacterium Azospirillum brasilense in the presence of various nitrogen sources // Microbiology. 2009. Vol. 78, № 6. P. 696–702. doi: 10.1134/S0026261709060058
30. Sheludko A.V., Kulibyakina O.V., Shirokov A.A., Petrova L.P., Matora L.Yu., Katsy E.I. The effect of mutations affecting synthesis of lipopolysaccharides and calcofluor-binding polysaccharides on biofilm formation by Azospirillum brasilense // Microbiology. 2008. Vol. 77, № 3. P. 313–317. doi: 10.1134/S0026261708030107
31. Stepanova L.V., Schelud’ko A.V., Katsy E.I., Ponomareva E.G., Nikitina V.E. The role of lectin-carbohydrate biospecific interactions between medicinal basidiomycetes mushroom Grifola frondosa (Dicks.: Fr.) S.F. Gray and Azospirillum brasilense during their co-cultivation // Int. J. Med. Mushrooms. 2008. Vol. 10, № 1. P. 65–72. doi:10.1615/IntJMedMushr.v10.i1.80
32. Burygin G.L., Shirokov A.A., Shelud’ko A.V., Katsy E.I., Shchygolev S.Y., Matora L.Y. Detection of a sheath on Azospirillum brasilense polar flagellum // Microbiology. 2007. Vol. 76, № 6. P. 728–734. doi:10.1134/S0026261707060124
33. Shelud’ko A.V. Borisov I.V., Krestinenko A.V., Panasenko V.I., Katsy E.I. Effect of Congo Red on the motility of the bacterium Azospirillum brasilense // Microbiology. 2006. Vol. 75, № 1. P. 48–54. doi: 10.1134/S0026261706010103
34. Petrova L.P., Borisov I.V., Katsy E.I. Plasmid rearrangements in Azospirillum brasilense // Microbiology. 2005. Vol. 74, № 4. P. 495–497. doi: 10.1007/s11021-005-0094-8
35. Petrova L.P., Matora L.Yu., Burygin G.L., Borisov I.V., Katsy E.I. Analysis of DNA, a number of cultural and morphological properties, and lipopolysaccharide structure in closely related strains of Azospirillum brasilense // Microbiology. 2005. Vol. 74, № 2. P. 188–193. doi: 10.1007/s11021-005-0050-7
36. Fedonenko Yu.P., Borisov I.V., Konnova O.N., Zdorovenko E.L., Katsy E.I., Konnova S.A., Ignatov V.V. Determination of the structure of the repeated unit of the Azospirillum brasilense SR75 O-specific polysaccharide and homology of the lps loci in the plasmids of Azospirillum brasilense strains SR75 and Sp245 // Microbiology. 2005. Vol. 74, № 5. P. 542–548. doi: 10.1007/s11021-005-0101-0
37. Кацы Е.И. Свойства и функции плазмид ассоциированных с растениями бактерий рода Azospirillum // Успехи современной биологии. 2002. Т. 122, № 4. C. 353–364
38. Katzy E.I. Characterization of genes identified in the 120-MDa plasmid of an Azospirillum brasilense Sp245 mutant defective in polar flagellation and swarming // Russ. J. Genet. 2002. Vol. 38, № 1. P. 15–24. doi: 10.1023/A:1013703509110
39. Katsy E.I., Borisov I.V., Petrova L.P., Matora L.Yu. The use of fragments of the 85- and 120-MDa plasmids of Azospirillum brasilense Sp245 to study the plasmid rearrangement in this bacterium and to search for homologous sequences in plasmids of Azospirillum brasilense Sp7 // Russ. J. Genet. 2002. Vol. 38, № 2. P. 124–131. doi: 10.1023/A:1014373725254
40. Katzy E.I., Borisov I.V., Scheludko A.V. Effect of the integration of vector pJFF350 into plasmid 85-MDa of Azospirillum brasilense Sp245 on bacterial flagellation and motility // Russ. J. Genet. 2001. Vol. 37, № 2. P. 129–134. doi: 10.1023/A:1009081603530
41. Kamneva A.B., Katzy E.I., Borisov I.V., Scheludko A.V., Panasenko V.I. Complementation analysis of associative bacteria Azospirillum brasilense Sp245 and S27 defective for motility and flagellation // Russ. J. Genet. 2001. Vol. 37, № 2. P. 135–140. doi: 10.1023/A:1009033720368
42. Shelud’ko A.V., Katsy E.I. Formation of polar bundles of pili and the behavior of Azospirillum brasilense cells in a semiliquid agar // Microbiology. 2001. Vol. 70, № 5. P. 570–575. doi: 10.1023/A:1012364323315
43. Katzy E.I., Shelud’ko A.V. Mapping of the fla locus in a plasmid with molecular weight of 120 MDa in Azospirillum brasilense Sp245 bacteria // Russ. J. Genet. 1999. Vol. 35, № 10. P. 1177–1182
44. Katzy E.I., Matora L.Yu., Serebrennikova O.B., Scheludko A.V. Involvement of a 120-MDa plasmid of Azospirillum brasilense Sp245 in production of lipopolysaccharides // Plasmid. 1998. Vol. 40, № 1. P. 73–83. doi: 10.1006/Plas.1998.1353
45. Scheludko A.V., Katsy E.I., Ostudin N.A., Gringauz O.K., Panasenko V.I. Novel classes of Azospirillum brasilense mutants with defects in the assembly and functioning of polar and lateral flagella // Мол. генет. микробиол. вирусол. 1998. № 4. С. 33–37
46. Кацы Е.И. Участие ауксинов в регуляции экспрессии генов бактерий и растений // Генетика. 1997. Т. 33, № 5. С. 565–576
47. Кацы Е.И. Генетико-биохимические и экологические аспекты подвижности и хемотаксиса у фитопатогенных, симбиотических и ассоциированных с растениями бактерий // Успехи современной биологии. 1996. Т. 116, № 5. С. 579–593
48. Кацы Е.И. Транспозон Tn5 и его производные, используемые в генетическом анализе бактерий // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1993. № 3. С. 12–15.
49. Кацы Е.И. Генетика азотфиксации и взаимодействия с растениями бактерий рода Azospirillum (Tarrand, Krieg & Döbereiner, 1979) // Генетика. 1992. Т. 28, № 7. С. 5–18
50. Katzy E., Brodnikova N., Egorenkov D., Panasenko V., Ignatov V. Anthranilate and indole-3-acetate production in Azospirillum brasilense Sp245 mutant derivatives // Symbiosis. 1992. Vol. 13, № 1/3. P. 147–150
51. Кацы Е.И., Журавлева Е.А., Панасенко В.И. Транспозоновый мутагенез, элиминация и мобилизация плазмид азотфиксирующей бактерии Azospirillum brasilense Sp245 // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 1990. № 2. С. 29–32
52. Katzy E.I., Iosipenko A.D., Egorenkov D.A., Zhuravleva E.A., Panasenko V.I., Ignatov V.V. Involvement of the Azospirillum brasilense plasmid DNA in the production of indole acetic acid // FEMS Microbiol. Lett. 1990. Vol. 72, № 1. P. 1–4. doi: 10.1016/0378-1097(90)90334-M
Пат. 2572350 Российская Федерация, MПК C12Q 1/04 (2006.01). Способ выявления бактерий рода Azospirillum, имеющих общие антигенные детерминанты в составе липополисахаридов / Шелудько А.В., Бурыгин Г.Л., Матора Л.Ю., Кацы Е.И., Широков А.А., Филипьечева Ю.А., Щеголев С.Ю.; заявитель и патентообладатель ИБФРМ РАН. № 2013114401/10; заявл. 01.04.2013; опубл. 10.01.2016, Бюл. № 1.
Лаборатория генетики микроорганизмов, созданная в ИБФРМ АН СССР (ныне ИБФРМ РАН) в 1985 г., ведет свое начало от лаборатории культивирования микроорганизмов, организованной в 1981 г. Генетические работы были инициированы молодым талантливым ученым Вадимом Юрьевичем Матвеевым (08.10.1960–28.12.1988). В течение первых 24-х лет лабораторией заведовал д.б.н., проф. Валерий Иванович Панасенко (14.03.1937–27.07.2005).
Монографии:
Главы в монографиях: