О научной и научно-организационной деятельности С.Ю. Щeголева

Доктор химических наук, профессорДоктор химических наук, профессор Сергей Юрьевич Щeголев, выпускник Саратовского государственного университета им. Н.Г. Чернышевского (СГУ), в 1985/1986 учебном году прошел обучение на курсах повышения квалификации и специализации работников в области молекулярной и физико-химической биологии в филиале Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (г. Пущино-на-Оке), доктор химических наук, профессор по кафедре органической и биоорганической химии.

С.Ю. Щeголев поступил на работу в ИБФРМ РАН в 1981 году, где прошел путь от старшего научного сотрудника до заведующего лабораторией иммунохимии, занимая эту должность с 1984 по 2023 год. В настоящее время С.Ю. Щеголев работает в должности ведущего научного сотрудника в данной лаборатории.

Более 15 лет С.Ю. Щеголев находился в составе руководства ИБФРМ РАН. С 2001 по 2007 годы он работал заместителем директора Института по научной работе. В январе 2008 г. С.Ю. Щеголев был утвержден Президиумом РАН в должности директора ИБФРМ РАН, а в декабре 2012 года повторно утвержден в этой должности на новый пятилетний срок, проработав директором Института с 2008 по 2017 годы.

С 2008 по 2017 годы в ИБФРМ РАН под руководством директора С.Ю. Щеголева проведена работа по дальнейшей консолидации усилий научных подразделений ИБФРМ РАН, направленных на выполнение фундаментальных и прикладных научных исследований в области растительно-микробных, иных симбиотических систем и биотехнологических разработок на их основе. С учетом сформулированной им с коллегами базовой концепции исследований молекулярных и клеточных механизмов взаимоотношений растений с ассоциативной микрофлорой разработана долговременная стратегия развития ИБФРМ РАН. Развивалось международное сотрудничество в рамках проектов по грантам от международных научных фондов и по прямым связям с зарубежными научными организациями. Регулярно на базе ИБФРМ РАН проводятся конференции с участием представителей ведущих российских и зарубежных научных школ. При активном участии С.Ю. Щеголева, в сотрудничестве с руководством ИФР РАН, были сформулированы предложения по развитию ряда научных направлений, поддержанные ОБН РАН, нашедшие отражение в Программе фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2013-2020 годы.

С 2006 года по настоящее время С.Ю. Щеголев входит в состав Научного совета по микробиологии РАН, состоит членом диссертационного совета 24.2.392.06 по биофизике при Саратовском госуниверситете (СГУ), неоднократно аккредитован в Федеральном реестре экспертов научно-технической сферы. С.Ю. Щеголев систематически выступает с приглашенными пленарными докладами на различных научных форумах и с лекциями на школах для молодых ученых.

За время участия С.Ю. Щеголева в руководстве институтом приборный парк ИБФРМ РАН пополнился самым современным высокоточным и высокопроизводительным научным оборудованием, что привело к созданию на его базе Центра коллективного пользования «Симбиоз». Благодаря успешно работающему в Институте УНЦ физико-химической биологии развивались интеграционные процессы и укреплялись связи ИБФРМ РАН с СГУ, другими вузами г. Саратова и Поволжского региона.

С.Ю. Щeголев постоянно руководит в ИБФРМ РАН госбюджетными темами НИР, неоднократно выступал в качестве руководителя и участника работ по грантам от российских и международных научных фондов. Их тематика связана с развитием методологии физико-химического, иммунохимического и биоинформатического анализа биополимеров и клеток в приложении к исследованиям молекулярно-генетических основ взаимоотношений почвенных микроорганизмов с растениями и задачам медицинской диагностики. Он является автором и соавтором около четырехсот публикаций, треть из которых – статьи в международных и рецензируемых российских научных журналах, 10-ти авторских свидетельств и патентов, 4-х монографий, 10-ти учебно-методических работ.

Под научным руководством и при непосредственном участии С.Ю. Щeголева были разработаны эффективные биотест-системы к компонентам микробных и растительных клеток, используемые для изучения структурной организации клеточной поверхности почвенных бактерий, выяснения молекулярных и клеточных механизмов взаимодействий микроорганизмов с растениями, устойчивости растений к действию неблагоприятных экологических факторов и т.п.

В лаборатории иммунохимии ИБФРМ РАН, руководимой С.Ю. Щeголевым, были развиты фундаментальные основы и оригинальные методики получения биоспецифических маркеров – коньюгатов золотых наночастиц с разнообразными биоспецифическими молекулами-зондами. Эти наноструктуры используются в качестве меток в световой и электронной микроскопии, твердофазном био- и иммуноанализе, иммунохроматографии, применяются как эффективные носители антигенов и адъюванты при получении антител к разнообразным низко- и высокомолекулярным антигенам и т.д. С.Ю. Щeголев является соавтором первой опубликованной в России в 2008 г. монографии по данной проблематике, ряда оригинальных и обзорных работ, вышедших в отечественных и международных изданиях.

За время существования лаборатории, возглавляемой С.Ю. Щеголевым, ее сотрудниками защищены 14 кандидатских и 6 докторских диссертаций. С 1990 по 2024 годы С.Ю. Щёголев работал по совместительству в СГУ в должности профессора кафедры органической и биоорганической химии, ведущей работу в составе УНЦ физико-химической биологии ИБФРМ РАН и СГУ, созданного в 1998 г. при активном участии С.Ю. Щёголева. В последние годы научно-педагогические интересы С.Ю. Щеголева сосредоточены в области биоинформатики, по которой он вел и ведет образовательную работу на основе разработанного им спецкурса со студентами, бакалаврами и магистрами с трех факультетов СГУ, с аспирантами и сотрудниками ИБФРМ РАН и СГУ.

В 1999 году С.Ю. Щеголев был награжден Почетной грамотой Президиума РАН и Профсоюза работников РАН, в 2016 году – Почетной грамотой Президиума РАН. В 2023 году получил нагрудный знак Минобрнауки России «Почетный наставник». В 2006 году С.Ю. Щeголев награжден медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени.

Список избранных научных трудов С.Ю. Щеголева за последние 5 лет

Статьи в рецензируемых изданиях
1. Shchyogolev S.Yu., Muratova A.Yu., Turkovskaya O.V., Matora L .Yu. The Rieske dioxygenase system in Achromobacter: in silico studies of the protein structure and substrate interactions // Archives of Microbiology. - 2026. - Vol. 208. – Art. 330. DOI: 10.1007/s00203-026-04905-7.
2. Shchyogolev S.Yu., Muratova A.Yu., Turkovskaya O.V., Matora L .Yu. In silico microbial enzymology: study of the oxidoreductase systems of Azospirillum // Microbiology (Russian Federation). – 2025. – Vol. 94, No. S1. – P. S45-S50. DOI: 10.1134/S0026261725604725.
3. Evseeva N.V., Denisova A.Yu., Tkachenko O.V., Shirokov A.A., Pozdnyakova N.N., Burygin G.L., Matora L.Yu., Shchyogolev S.Yu. Rhizobacteria in the regulation of the pro- and antioxidant systems of potato osmotically stressed in vitro // Russian Journal of Plant Physiology. – 2025. – Vol. 72. – Art. 59. DOI: 10.1134/S1021443724609807.
4. Galeva A.V., Zhao D., Syutkin A.S., Topilina M.Yu., Shchyogolev S.Yu., Pavlova E.Yu., Selivanova O.M., Kireev I.I., Surin A.K., Burygin G.L., Liu J., Xiang H., Pyatibratov M.G. Tat-fimbriae ("tafi"): An unusual type of haloarchaeal surface structure depending on the twin-arginine translocation pathway // iScience. – 2025. – Vol. 28, No. 2. – Art. 111793. DOI: 10.1016/j.isci.2025.111793.
5. Shchyogolev S.Yu., Dykman L.A., Sokolov A.O., Sokolov O.I., Matora L.Yu. Quantitative intra- and intergeneric taxonomic relationships among Micrococcaceae strains reveal contradictions in the historical assignments of the strains and indicate the need for species reclassification // Arch. Microbiol. – 2024. – Vol. 206, article number 165. DOI: 10.1007/s00203-024-03896-7.
6. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Дыкман Л.А., Матора Л.Ю. Филогенетический и пангеномный анализ представителей семейства Micrococcaceae, родственных стимулирующей рост растений ризобактерии, изолированной из ризосферы картофеля (Solanum tuberosum L.) // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2024. – Т. 28, №3. – С. 308-316. DOI: 10.18699/vjgb-24-35.
7. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Красова Ю.В., Матора Л.Ю. Пептидные паттерны MAMP бактериальных флагеллинов и их взаимодействия с растительными рецепторами: биоинформатический и коэволюционный аспекты // Микробиология. – 2024. – Т. 93, №2. – С. 179-188. DOI: 10.31857/S0026365624020155.
8. Каргаполова К.Ю., Ткаченко О.В., Бурыгин Г.Л., Евсеева Н.В., Широков А.А., Матора Л.Ю., Щёголев С.Ю. Повышение эффективности клонального микроразмножения картофеля при инокуляции ризосферными бактериями Azospirillum baldaniorum Sp245 и Ochrobactrum cytisi IPA7.2 // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2022. – Т. 26, №4. – С. 422-430. DOI: 10.18699/VJGB-22-52.
9. Tkachenko O.V., Evseeva N.V., Terentyeva E.V., Burygin G.L., Shirokov A.А., Burov A.М., Matora L.Yu., Shchyogolev S.Yu. Improved production of high-quality potato seeds in aeroponics with plant-growth-promoting rhizobacteria // Potato Res. – 2021. – V. 64, Iss. 1. – P. 55-66. DOI: 10.1007/s11540-020-09464-y.
10. Tkachenko O.V., Burygin G.L., Evseeva N.V., Fedonenko Yu.P., Matora L.Yu., Lobachev Yu.V., Shchyogolev S.Yu. Morphogenesis of wheat calluses by the treatment with lipopolysaccharides from Azospirillum spp. // Plant Сell Tissue Organ Cult. – 2021. – Vol. 147. – P. 147-155. DOI: 10.1007/s11240-021-02114-2.
11. Golubev S.N., Muratova A.Yu., Panchenko L.V., Shchyogolev S.Yu., Turkovskaya O.V. Mycolicibacterium sp. strain PAM1, an alfalfa rhizosphere dweller, catabolizes PAHs and promotes partner-plant growth // Microbiol. Res. – 2021. – Vol. 253, No. 126885. – P. 1-16. DOI: 10.1016/j.micres.2021.126885.
12. Щеголев С.Ю. Рецензия на учебное пособие «Биоразнообразие и систематика микроорганизмов», авт. И.Б. Ившина, А.В. Криворучко, М.С. Куюкина // Микробиология. 2021. Т. 90, № 2. С. 247-249. DOI: 10.31857/s0026365621010079.

Тезисы и сообщения в материалах конференций
1. Щеголев С.Ю., Муратова А.Ю., Турковская О.В., Матора Л.Ю. Оксигеназная система Риске в видовом разнообразии Achromobacter: 3D-структура белков с кофакторами и взаимодействия с субстратами in silico // Сборник тезисов IV Международной конференции «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов». – Москва: Изд-во Перо, 2026. – С. 124.
2. Щеголев С.Ю., Топилина М.Ю., Пятибратов М.Г. Тат-фимбрии (tafi) у прокариотов: выявление и исследование белковых компонентов tafi-подобных структур среди архей и бактерий // Сборник тезисов IV Международной конференции «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов». – Москва: Изд-во Перо, 2026. – С. 119.
3. Щеголев С.Ю., Муратова А.Ю., Турковская О.В., Матора Л.Ю. Микробная энзимология in silico в изучении оксидоредуктазных систем азоспирилл // 5-й Российский микробиологический конгресс: сб. тез., Волгоград, 29 сентября – 3 октября 2025 г. – С. 138-139.
4. Пятибратов М.Г., Топилина М.Ю., Галева А.В., Сюткин А.С., Кислов Д.М., Щеголев С.Ю. TАФИ – уникальные поверхностные структуры галоархей // 5-й Российский микробиологический конгресс: сб. тез., Волгоград, 29 сентября – 3 октября 2025 г. – C. 93-94.
5. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Матора Л.Ю., Фадеева Ю.В. Молекулярное моделирование взаимодействия рецептора FLS2 с лигандами с применением AlphaFold3 // Тез. II Всеросс. науч. школы-конф. мол. ученых и студентов «Генетические технологии в исследованиях природных соединений», (Владивосток, 23–28 сентября 2024 г.), ТИБОХ ДВО РАН. – Владивосток: Изд-во Дальневосточного федерального университета, 2024. – С. 28.
6. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Дыкман Л.А., Матора Л.Ю. Пангеномный анализ прокариот как эффективный инструмент в таксономических и функциональных исследованиях представителей семейств Micrococcaceae и Azospirillaceae // Международный конгресс «VIII съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров»: Сборник тезисов, Саратов, 14-19 июня 2024 г. – С. 455.
7. Бурыгин Г.Л., Константинова Е.А., Матора Л.Ю., Щеголев С.Ю. Соотнесение систем серотипирования бактерий с их современным таксономическим положением // Мат. Всерос. конф. «Фундаментальная гликобиология–2023», Мурманск, 11–15 сентября 2023 г. - – Мурманск: Изд-во МАУ, 2023. – С. 89.
8. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Красова Ю.В., Матора Л.Ю. Пептидные паттерны MAMP бактериальных флагеллинов и их взаимодействия с растительными рецепторами: биоинформатический и коэволюционный аспекты // Тезисы 4-го Российского микробиологического конгресса. Томск, 24-29 сентября 2023 г. С. 149.
9. Щеголев С.Ю., Тихонов К.С., Андрейченко Д.К. Об опыте инсталляции и использования программного комплекса AlphaFold2 и его оптимизированных версий для определения 3D-структур белков и белковых комплексов // Методы компьютерной диагностики в биологии и медицине – 2022: Сборник статей Всероссийской школы-семинара / под ред. проф. Ан.В. Скрипаля. – Саратов: Изд-во «Саратовский источ-ник», 2022. – С. 100-106.
10. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Соколов А.О., Ткаченко О.В., Дыкман Л.А., Соколов О.И., Матора Л.Ю. Технология GTDB на пути построения «таксономической структуры от домена к виду»: небольшой привал в семействе Micrococcaceae // III межд. конф. «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» (PLAMIC2022), Санкт-Петербург, Россия, 3-8 окт. 2022. – С. 245.
11. Щеголев С.Ю., Бурыгин Г.Л., Красова Ю.В., Пятибратов М.Г. Методы и результаты предсказаний сайтов гликозилирования белков прокариотов на примере флагеллинов // Сб. тез. V Всеросс. конф. «Фундаметальная гликобиология», 21-24 сентября 2021 г., Гатчина, 2021. – С. 102-103.
12. Щеголев С.Ю. Искусственный интеллект для наук о жизни: о прорывной технологии Alphafold2 в области предсказаний пространственной структуры белков // Методы компьютерной диагностики в биологии и медицине - 2021: Сборник статей Всероссийской школы-семинара / под ред. проф. Ан.В. Скрипаля. – Саратов: Изд-во Саратовский источник, 2021. – С. 15-20.

См. также: https://orcid.org/0000-0002-1084-312X